Вы здесь

Итоги научно-практической деятельности ФБУН «Ростовский НИИ микробиологии и паразитологии» Роспотребнадзора в 2021 году

В соответствии с целями Концепции научного обеспечения на 2021-2025 гг., утвержденной приказом руководителя Роспотребнадзора от 24.12.2020 № 869, и в рамках реализации отраслевой научно-исследовательской программы «Научное обеспечение эпидемиологического надзора и санитарной охраны территории Российской Федерации. Создание новых технологий, средств и методов контроля и профилактики инфекционных и паразитарных болезней» институтом выполнялись 12 научно-исследовательские работы (НИР).

Основными направлениями научной деятельности института являются:

•        Научное и методическое обеспечение эпидемиологического надзора за вирусными и бактериальными инфекциями на основе выявления рисков и прогнозирования эпидемиологической ситуации. Разработка эффективных средств лабораторной диагностики и мониторинга возбудителей.

•        Решение актуальных проблем эпидемиологического надзора, лабораторной диагностики и профилактики природно-очаговых инфекций и паразитарных болезней

•        Разработка и внедрение новых поколений диагностических, профилактических, лекарственных иммунобиологических препаратов на основе использования современных методов биотехнологии и генной инженерии.

  1. Проводится комплексный анализ эпидемиологической ситуации по распространению социально-значимых инфекций (ВИЧ-инфекция и COVID-19), определены тенденции развития эпидемического процесса ВИЧ-инфекции на территории ЮФО и СКФО. В 2021 году на юге России наблюдалась территориальная неравномерность развития эпидемического процесса, выраженная в увеличении общего числа людей, живущих с ВИЧ во всех субъектах ЮФО и СКФО. Результаты исследований свидетельствуют о продолжении регистрации в 2021 году новых случаев заболевания ВИЧ-инфекцией. Это обусловлено интенсификацией миграционных процессов на Юге России и расширением эпидемиологических сетей с вовлечением в эпидемический процесс ВИЧ-инфекции социально сохранных слоев населения. Показано, что в эпидемический процесс новой коронавирусной инфекции были вовлечены больные ВИЧ-инфекцией. Клиническое течение COVID-19 у больных ВИЧ-инфекцией в 48,8% случаев характеризовалось легким течением, в 40,5% - средней тяжестью и 10,7% - тяжелой и крайне тяжёлой формой заболевания.

По результатам изучения гуморального иммунитета к SARS-CoV-2 осуществлялась текущая оценка эффективности специфической профилактики COVID-19. Проведено фрагментное секвенирование 797 проб биоматериала у лиц, давших положительный результат в ПЦР к SARS-CoV-2.

Доминирующим штаммом был геновариант дельта (индийский) (92,4%), выявление которого совпало с ростом заболеваемости и увеличением случаев тяжелого течения. В течение отчетного года осуществлялся еженедельный мониторинг развития эпидпроцесса новой коронавирусной инфекции на территории Ростовской области с оценкой эффективности и разработкой новых адекватных санитарно-противоэпидемических (профилактических) мероприятий с целью сдерживания распространения COVID-19. При выполнении научно-исследовательской работы по изучению эпидемиологических аспектов новой коронавирусной инфекции в Ростовской области была разработана математическая модель, позволяющая осуществлять прогнозирование развития эпидемического процесса распространения инфекции на примере области. На базе модели SEIR  продолжается обработка данных и анализ материалов по случаям гибели людей при пандемии COVID-19 в регионе с целью прогнозирования развития эпидемиологической ситуации в районах области.

  1. Проведены научные исследования звеньев процесса возникновения и распространения инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП). Выявлено достаточно широкое разнообразие и высокая степень обсемененности проб, взятых из ротоглоток медицинского персонала в обследованных медицинских организациях (МО), условно-патогенными микроорганизмами, при снижении частоты встречаемости представителей нормальной микрофлоры исследуемого биотопа. Также отмечена высокая доля штаммов устойчивых к антибактериальным препаратам, что может служить одним из факторов, способствующих профессиональной заболеваемости среди работников МО. Выявлена взаимосвязь между нарастанием антибиотикорезистентности условно-патогенных микроорганизмов, выделенных из проб биоматериала, и формированием профессиональной заболеваемости у медицинского персонала  на примере медицинских организаций города Ростова-на-Дону.
  2. Предложен вариант использования данных масс-спектрометрического анализа микроорганизмов с применением дополнительно программного обеспечения MALDI Quant и среды R для определения маркеров антибиотикорезистентности. Рассматривается возможность обнаружения маркеров  патогенности бактерий при белковом профилировании их  на базе масс-спектрометрии.
  3. Проведен анализ микрофлоры мокроты больных внебольничными пневмониями (ВП) на фоне протекающей эпидемии новой коронавирусной инфекции. Наиболее часто этиологическим агентом ВП бактериальной природы являлись бактерии рода Streptococcus spp. как у пациентов с COVID-19, так и больных ВП с отрицательным результатом на SARS-CoV-2.  В материале мокроты выявлено значительное повышение показателей про-и  противовоспалительных цитокинов на местном уровне, что свидетельствовало о формировании «цитокинового шторма»  при остром  респираторном дистресс-синдроме.
  4. Выявлены наиболее характерные морфологические признаки нарушений структуры эндотелия у больных хроническим гепатитом C (ХГС). В результате комплексного изучения показателей функционального состояния и морфологической структуры эндотелия синусоидов определено их патогенетическое значение при хроническом гепатите C. Выявлено наличие прямой корреляционной связи между показателями активности фактора Виллебранда (ФВ) и наличием деструкции эндотелия синусоидов. Усовершенствован метод оценки эндотелиальной дисфункции (ЭД) (патент РФ на изобретение №2734683), позволяющий неинвазивным способом на ранних этапах заболевания выявлять функциональные и структурные нарушения эндотелия синусоидов у больных ХГС, позволяющий в каждом конкретном случае осуществить выбор терапевтической стратегии.
  5. Продолжены и расширены исследования по изучению циркуляции потенциально патогенных микроорганизмов.  При проведении санитарно-бактериологического мониторинга качества воды изучаемых в водных объектах Ростовской области выявлена высокая степень их загрязнения санитарно-показательными микроорганизмами. Обнаружение клебсиелл, цитробактеров, энтеробактеров, аэромонад, кишечных и синегнойных палочек представляет эпидемиологические риски, связанные с водным  фактором передачи инфекции.
  6. Осуществляется разработка высокоиммуногенной отечественной ротавирусной вакцины для детей. На основе высокотитражных штаммов ротавируса человека создан экспериментальный препарат «композиция инактивированных штаммов ротавируса человека», обладающий иммуногенными свойствами (исследовано на лабораторных животных). Проводится исследование по  определению пирогенных свойств вакцинной композиции в сравнении со стандартной  инактивированной вакциной (гриппозная).
  7. Проведены научные исследования по совершенствованию технологии получения отечественной конъюгированной антигенной субстанции гемофильного тип b микроба. Разработаны два технологических решения получения конъюгированной субстанции, применение которых позволяет получать нетоксичные, безопасные субстанции Hib, обеспечивающие достаточный уровень антигенности, которые могут использоваться как при создании конъюгированных моно- Hib-вакцин, так и в качестве компонента в комбинированных вакцинах.
  8. В рамках санитарно-паразитологического мониторинга получены данные по обсемененности эпидемиологически значимых объектов окружающей среды (почва, сточные воды и их осадки) территорий  юга России. Проанализирован опыт применения современных информационных технологий для эпидемиологического анализа распространения возбудителей паразитарных болезней по материалам  печатных работ современных российских и зарубежных авторов. Для разработки   базы данных о распространении возбудителей ларвальных гельминтозов на территории субъектов Российской Федерации проводится  анализ заболеваемости паразитарными болезнями. Проводимый мониторинг санитарно-паразитологических исследований объектов внешней среды на юге России позволяет изучить распространенность гельминтозов и протозоозов с использованием оптимальных методов комплексной паразитологической диагностики с целью разработки геоинформационных систем мониторинга (ГИС) для  оценки современной эпидемиологической ситуации по паразитозам на юге России.
  9.  Разработан комплексный подход диагностики и внутривидовой дифференциации гельминтов, основанный на использовании современных молекулярно-биологических методов (ПЦР, метод масс-спектрометрического анализа с применением MALDI-TOF MS), позволяющий повысить эффективность лабораторной диагностики паразитарных заболеваний и идентификации возбудителя, а также проводить мониторинг возбудителей дирофиляриоза и других гельминтозов. ПЦР-исследования показали не только быстроту исполнения, но и высокую чувствительность,  специфичность и возможность дифференциации ДНК D. immitis и D. repens. Отработаны этапы   пробоподготовки и условия проведения реакции ПЦР. Определены репрезентативные протеиновые масс-спектры белковых экстрактов D. immitis и D. repens, A. suum и А. lumbricoides  при исследовании методом масс-спектрометрии при использовании программного обеспечения Flex analysis MALDI-TOF MS . Подготовлен материал для  пополнения базы масс-спектров с целью расширения возможностей MALDI-TOF MS в направлении лабораторной диагностики возбудителей паразитарных болезней.
  10. В соответствии с поручением Федеральной службы по надзору  в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по проведению мониторинга и анализа эпидситуации по заболеваемости COVID-19 с оценкой проводимых профилактических и противоэпидемических мероприятий, прогнозированию развития эпидситуации в регионе (письмо №02/11343-2020-26 от 05.06.2020 и приказ №1116 от 01.12.2017)  на базе ФБУН РостовНИИ микробиологии и паразитологии Роспотребнадзора в период пандемии COVID-19 проводилась следующая работа:

Еженедельно специалистами ФБУН РостовНИИ микробиологии и паразитологии проводился мониторинг и составлялся анализ эпидемиологической ситуации по новой коронавирусной инфекции с оценкой эффективности проводимых профилактических и противоэпидемических мероприятий в Ростовской области: еженедельная динамика регистрации новых случаев заражения новой коронавирусной инфекцией COVID-19 в Ростовской области, смертей, выздоровлений;  анализ заболеваемости COVID-19 по возрастным группам и группам повышенного риска при COVID-19 и др. С ноября 2020 г. В ФБУН РостовНИИ микробиологии и паразитологии Роспотребнадзора начались исследования по определению у населения методом ИФА специфических антивирусных антител, относящихся к классам М и G, в рамках изучения формирования специфического иммунного ответа после перенесенной новой коронавирусной инфекции и после вакцинации.

В целях выявления на территориях Ростовской области, Республики Крым и г. Севастополь новых генетических вариантов возбудителя коронавирусной инфекции в ФБУН РостовНИИ микробиологии и паразитологии Роспотребнадзора осуществляется фрагментное секвенирование материала от больных с положительным результатом в ПЦР на COVID-19.

Проведено изучение этиологии внебольничных пневмоний. В период распространения новой коронавирусной инфекции в Ростовской области определено, что основным этиологическим агентом внебольничных пневмоний являлся новый коронавирус SARS-CoV-2. Особенностью ВП у пациентов с лабораторно подтвержденным COVID-19 является более высокая частота микст-инфекций как вирусной, так и бактериальной этиологии. На фоне выявления у пациентов с внебольничными пневмониями РНК SARS-CoV-2 зарегистрированы случаи обнаружения коронавирусов других типов (HKU-1,OC43, HL-63 или 229Е).

Проведена значимое исследование по определению социально-экономического бремени, наносимого COVID-19.  В результате исследования было определено, что помимо непосредственного воздействия на здоровье уязвимых групп населения, эпидемия неизбежно будет иметь долгосрочные социально-экономические последствия как для людей, так и для сообществ, в которых они живут.

В 2021 году за большой вклад в организацию работы по предупреждению и предотвращению распространения коронавирусной инфекции (COVID-19) Указом Президента России 5 сотрудников института были награждены государственными наградами: Орденом Пирогова награждены 2 и Медали Луки Крымского удостоены 3 сотрудника.

9-10 сентября 2021 года проведены Межрегиональная научно-практическая конференция «Актуальные вопросы эпидемиологического надзора за инфекционными и паразитарными заболеваниями на юге России. Ермольевские чтения», посвященная памяти, достижениям и заслугам выдающегося российского ученого с мировым именем, создателя отечественного пенициллина и других антибиотиков, основоположника современной антибактериальной терапии, академика Ермольевой З.В. и Региональное совещание «Актуальные вопросы эпидемиологического надзора за паразитарными заболеваниями в Южном и Северо-Кавказском федеральных округах». Конференция приурочена к 100-летнему юбилею начала трудовой научной деятельности Ермольевой З.В. в Ростовском Бактериологическом институте (ныне ФБУН «РостовНИИ микробиологии и паразитологии» Роспотребнадзора). По материалам конференции и совещания выпущен сборник научных трудов.

Теоретические и экспериментальные материалы по комплексу исследований, проводимых в институте в 2021 году, были освещены в публикациях в научных журналах (78 статей), представлены на конференциях и совещаниях, размещены на портале препринтов. Специалисты института активно участвовали в работе по актуализации, пересмотру и разработке нормативных и методических документов различного уровня для обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения; получили 4 патента на изобретение.

Научно-производственная деятельность

Ежегодно институт осуществляет выпуск вакцинных препаратов. В рамках выполнения государственного заказа произведена и направлена в субъекты РФ вакцина гемофильная тип b конъюгированная (выполнение Национального календаря профилактических прививок). В соответствии с заявками осуществлен выпуск вакцины лептоспирозной концентрированной жидкой.

 

Материал опубликован на сайте Роспотребнадзора https://www.rospotrebnadzor.ru/about/info/predpr/news_predpr.php?ELEMENT_ID=20389

Вернуться назад